Mol Cell:张锋再造；还有组合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，斯坦福大学和芝加哥大学Broad资料分析所传来好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等研究小组联合开发不止一种新型的抗病毒系统对。21世纪上有许多常见的有显然寄生虫都是基于丝氨酸RNA的病毒，好像传染病病毒、寨卡病毒和流感病毒。该系统对在CRISPR Cas13技术的基础上最后升级，可用于验证和破坏进化巨噬细胞里面具丝氨酸RNA的病毒。该资料分析发表在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR系统对为抗病毒方法造成了黎明之前，张锋小组的资料分析职员凭借着CRISPR/Cas9系统对为修补免疫系统对抵抗病毒入侵造成了属于自己希望。然而，入侵进化的病毒极为多变，即使是在同一特有种内，也能急剧专一。因此我们勉强更为自如的预防病毒游戏平台。为了探索属于自己抗病毒策略，资料分析职员将目光叛离了CRISPR Cas13系统对，Cas13底物可以天然地类似物细菌里面的病毒RNA。它可以对蛋白质进行编程，从病毒胶体里面去除特定的核糖碱基。尽管CRISPR Cas13系统对仍然普遍存在一些局限病态，但是该方法在的实验室里面易于操作，并且之前张锋小组的资料分析职员在哺乳动物巨噬细胞里面已经进行了充分的实验假定。资料分析职员开发了一种取名CARVER的新型游戏平台，它能将Cas13介导的病毒RNA裂解与基于Cas13的慢速诊断测不止结合起来，常用特定的高灵敏度底物研究报告分子解锁（SHERLOCK）游戏平台，验证消灭基于RNA的病毒。创建三合一的系统对资料分析职员首先审核了350多个进化方面病毒（HAV）遗传物质，以鉴定Cas13可以必要类似物的病毒RNA碱基。他们主要寻找的是既易于甲基化，又最有显然在切割后去除病毒的片段。病毒遗传物质里面潜在的Cas13最大限度启动子芝加哥大学Cameron Sabeti的实验室的博士后Myhrvold博士表示：“理论上，你可以编程Cas13来偷袭病毒的任何部分。但是特有种核心和特有种之间都有巨大的多样病态，随着病毒的进化，基本上遗传物质都发生了短时间内的变化。如果你不小心，你显然会信念最终没有优点的最大限度。”然后，他们通过计算分析测序资料，以确定数百种病毒特有种里面的数千个潜在启动子，这些启动子显然是Cas13的必要靶标。接下来，资料分析职员设计了该系统对的Cas13指导RNA。新编程的Cas13在感染了淋巴巨噬细胞病态脉络膜脑膜炎病毒（LCMV）、流感流感病毒（IAV）和水泡病态口炎病毒（VSV）的进化巨噬细胞里面进行了实验测试。将Cas13引入试样后24足足，资料分析职员观察到培养物里面病毒RNA的总体提高了40倍。随后，资料分析职员检查了Cas1可抑制病毒感染病态的自如性。资料分析资料标示出：病毒曝露后八足足，Cas13将流感病毒的感染力提高了300倍以上。最后，该小组常用SHERLOCK验证技术来实时计算Cas13类似物后的病毒RNA总体。该验证系统对提供了有关治果的慢速反馈以及有关特定病毒甲基化的信息。结语对于病毒感染的疗程，虽然已经批准了90多种抗病物，但它们勉强疗程9种病症。总体而言，只有16种病毒具FDA批准的HIV。因此，见到系统地的抗病毒方法显得尤为重要。该资料分析的第一作者 Catherine Freije 表示：“Cas13可以是一种资料分析物件，来探索进化巨噬细胞里面病毒生物学的许多多方面，它也显然是一种临床物件，用于诊断样本，疗程病毒感染，并计量疗程的持续病态——所有这些都能让CARVER在属于自己或耐药病态病毒不止现时短时间内适应和应对。”原始不止处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]